包装纸箱的主要结构可以有平口纸箱、搭口纸箱及大盖纸箱这几类，包装纸箱的结构可以根据所需包装产品的特点进行设计，通常来看，运用多的一种形式为平口纸箱。

搭口纸箱的结构与平口纸箱比较，更具有保护性，能够对产品起到很好的保护作用。例如在包装一些体积较为膨胀的棉织衣服的时候，在经过一段时间的重力压之后产品会被压缩，这时如果使用的是平口纸箱包装，则会导纸箱两边的摇盖无法进行合拢，造成箱内商品露出。对于这种情况来看，使用搭口纸箱则更为合适，搭口多少可根据商品的具体情况而设定。

大盖纸箱的外表是比较整齐的，相对比前两种纸箱来说，这种结构对于内部的产品保护性能更为突出，但是这种纸箱的制作需要耗费更多的原材料，其生产过程也对相对复杂一些。